調査した63地点

図３. aは地点8の礁斜面、bは地点21の礁池でのサンゴ礁。ダイバーが直接観察によって同定した造礁サンゴ属と環境DNA解析法によって同定された属はほぼ完全に一致した。

脊索動物（ヒトを含む）の背側神経系を作りだす遺伝子はイトマキヒトデ（水腔動物の中の棘皮動物）の繊毛帯を作り出すように働いている。つまり、この二つの領域は相同であることが分かる。

22個のクラスターのそれぞれが、（A,B）原腸胚と（C,D,E）幼生のどの部分を構成する細胞を含むのかを、発生関連遺伝子の発現パターンから決めることができる。例えば８のクラスターは頂板を、９のクラスターは体腔中胚葉を特徴づける。

同時観察調査のイメージ。海中でのダイバーによる直接目視観察と船上での表面海水からの環境DNAの採集を同時に行い、その結果を比較した。

A）ヒトデの後期原腸胚の口陥部で働く遺伝子。これらの多くはシュペーマン・オーガナイザー（形成体）で発現する。(B) 脊索動物の背側構造（脊索と底板）で発現する遺伝子群（左）と水腔動物の口陥部分（Aの波線部で横断図）で発現する遺伝子群（右）の比較。相同遺伝子が数多く発現することから、水腔動物の口陥部分は脊索動物の背側構造部分と相同と言える。